手術室凈化施工的步驟如下：

1. 控制氣流：首先過濾掉空氣中的有害物質。

2. 初級凈化：排除空氣中的微粒子、有害氣體、細菌等污染物質，并將室內潔凈度、壓力、溫度、氣流速度、噪音、照明及靜電控制在合理范圍。

3. 溫濕處理：使用空調系統控制氣流流通，進而控制手術室內的溫濕度。

4. 空氣過濾：使用初效過濾器進行空氣過濾，將室內空氣中≥0.5μm的微粒數和空氣中的細菌過濾，過濾容易產生化學反應的一些不必要的空氣。

5. 再次送風：使用高效送風口或FFU送風單元，將過濾后的空氣送出手術室，將潔凈氣流送入手術室。

6. 正壓送回風：空調系統將局部環境中的風經過凈化后再送回局部環境。